Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RANBP10Q6VN20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANBP10Q6VN20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP10Q6VN20 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms