Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCBE1Q6UXH8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms