Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms