Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA5Q6Q788 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA5Q6Q788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA5Q6Q788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms