Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C22orf39Q6P5X5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C22orf39Q6P5X5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C22orf39Q6P5X5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms