Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
REEP3Q6NUK4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REEP3Q6NUK4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms