Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT39Q6A163 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT39Q6A163 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT39Q6A163 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms