Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOCADQ5VW36 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOCADQ5VW36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOCADQ5VW36 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FOCADQ5VW36 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms