Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GARNL3Q5VVW2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GARNL3Q5VVW2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms