Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1J5

CHCHD2P9, Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P9Q5T1J5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms