Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH8Q5T0T0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH8Q5T0T0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH8Q5T0T0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms