Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF3Q5SZQ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CELF3Q5SZQ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms