Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NHSL1Q5SYE7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NHSL1Q5SYE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NHSL1Q5SYE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms