Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO47Q5MNV8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO47Q5MNV8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO47Q5MNV8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms