Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12AQ5D1E8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZC3H12AQ5D1E8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZC3H12AQ5D1E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms