Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALFQ53S48 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALFQ53S48 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALFQ53S48 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms