Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP55Q53EZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP55Q53EZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP55Q53EZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP55Q53EZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP55Q53EZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP55Q53EZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms