Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GREB1Q4ZG55 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GREB1Q4ZG55 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms