Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO43Q4G163 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO43Q4G163 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms