Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP221Q4G0U5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP221Q4G0U5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms