Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01559Q495D7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01559Q495D7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms