Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms