Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00303Q3SY05 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00303Q3SY05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00303Q3SY05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms