Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BSXQ3C1V8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSXQ3C1V8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms