Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C18orf21Q32NC0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms