Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPRED3Q2MJR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRED3Q2MJR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRED3Q2MJR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms