Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2SQ16763 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE2SQ16763 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE2SQ16763 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms