Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF239Q16600 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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