Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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SSX1Q16384 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSX1Q16384 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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SSX1Q16384 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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SSX1Q16384 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSX1Q16384 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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