Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA4Q16363 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA4Q16363 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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