Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN9AQ15858 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN9AQ15858 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN9AQ15858 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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