Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCEA2Q15560 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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