Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBBP5Q15291 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP5Q15291 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP5Q15291 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms