Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRKQ15262 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
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