Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD3Q15059 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD3Q15059 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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