Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAM2Q15035 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAM2Q15035 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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