Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIN2CQ14957 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2CQ14957 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2CQ14957 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms