Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC1AQ14683 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC1AQ14683 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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