Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM25Q14258 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM25Q14258 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms