Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIRBPQ14011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CIRBPQ14011 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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