Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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TNFAIP1Q13829 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP1Q13829 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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TNFAIP1Q13829 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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TNFAIP1Q13829 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP1Q13829 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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