Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNA1SQ13698 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA1SQ13698 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
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