Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms