Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMQ13315 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMQ13315 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMQ13315 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMQ13315 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMQ13315 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMQ13315 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATMQ13315 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATMQ13315 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATMQ13315 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATMQ13315 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATMQ13315 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATMQ13315 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATMQ13315 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATMQ13315 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATMQ13315 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATMQ13315 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ATMQ13315 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATMQ13315 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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