Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DDX10Q13206 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DDX10Q13206 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DDX10Q13206 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms