Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFEMP1Q12805 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP1Q12805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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