Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 APE1YKL103C 1545 nt5.32□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 TUP1YCR084C 2142 nt5.32□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 GAL10YBR019C 2100 nt5.32□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 ATR1YML116W 1629 nt5.31□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SYN8YAL014C 768 nt5.31□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 NAT5YOR253W 531 nt5.31□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 CAR1YPL111W 1002 nt5.31□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 ATE1YGL017W 1512 nt5.31□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 HES1YOR237W 1305 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 RPS16BYDL083C 432 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YJL068CYJL068C 900 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 XPT1YJR133W 630 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 PRS1YKL181W 1284 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 ISU2YOR226C 471 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SIP5YMR140W 1470 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SOG2YOR353C 2376 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 AVT3YKL146W 2079 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 PRT1YOR361C 2292 nt5.3□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 MMP1YLL061W 1752 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 NRD1YNL251C 1728 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SNF3YDL194W 2655 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 KNH1YDL049C 807 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YEL028WYEL028W 462 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 UBC6YER100W 753 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SKI8YGL213C 1194 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 FMP48YGR052W 1110 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SKI6YGR195W 741 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YKR075CYKR075C 924 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 POM33YLL023C 840 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YOR292CYOR292C 930 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YIL067CYIL067C 2037 nt5.29□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 STE12YHR084W 2067 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 IML2YJL082W 2196 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YAP1YML007W 1953 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 SNM1YDR478W 597 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 RML2YEL050C 1182 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 NAG1YGR031C-A 492 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 YTA12YMR089C 2478 nt5.28□□□□□ -1.56
AVL9Q12500 TEA1YOR337W 2280 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 FAA4YMR246W 2085 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 ADE13YLR359W 1449 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 CTR3YLR411W 726 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MRPL4YLR439W 960 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 GTR1YML121W 933 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 HAP1YLR256W 4509 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PSE1YMR308C 3270 nt5.27□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 BIT2YBR270C 1638 nt5.26□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PRP45YAL032C 1140 nt5.26□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 KTI12YKL110C 942 nt5.26□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YPL113CYPL113C 1191 nt5.26□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 APL6YGR261C 2430 nt5.26□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PCL10YGL134W 1302 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 ZUO1YGR285C 1302 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 THI21YPL258C 1656 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MAD3YJL013C 1548 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 GET3YDL100C 1065 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MLC1YGL106W 450 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YBL029WYBL029W 1131 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 ETR1YBR026C 1143 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SAM4YPL273W 978 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YPR109WYPR109W 885 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 RRN3YKL125W 1884 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 APJ1YNL077W 1587 nt5.25□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MEC3YLR288C 1425 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PUS1YPL212C 1635 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YDL121CYDL121C 450 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 RSM10YDR041W 612 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PIC2YER053C 903 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SCW10YMR305C 1170 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 PRR1YKL116C 1557 nt5.24□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 CUE2YKL090W 1332 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SVF1YDR346C 1446 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 GIP1YBR045C 1920 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 OCA5YHL029C 2040 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 FRE3YOR381W 2136 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 ARP10YDR106W 855 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SPO74YGL170C 1242 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YGR182CYGR182C 354 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SEC13YLR208W 894 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YBL081WYBL081W 1107 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 CYK3YDL117W 2658 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 WTM2YOR229W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 IMA1YGR287C 1770 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MCX1YBR227C 1563 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MRF1YGL143C 1242 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 YGR011WYGR011W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 MAD2YJL030W 591 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 DHH1YDL160C 1521 nt5.22□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 DBF4YDR052C 2115 nt5.21□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 SEC39YLR440C 2130 nt5.21□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 STE20YHL007C 2820 nt5.21□□□□□ -1.57
AVL9Q12500 HER2YMR293C 1395 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 NOB1YOR056C 1380 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 SCM3YDL139C 672 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 MHR1YDR296W 681 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 SEH1YGL100W 1050 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 YGL185CYGL185C 1140 nt5.21□□□□□ -1.58
AVL9Q12500 SPL2YHR136C 447 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms