Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 DOA1YKL213C 2148 nt4.78□□□□□ -1.64
MSH5Q12175 ESF1YDR365C 1887 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 SKG3YLR187W 3081 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 SAP155YFR040W 3009 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 ATG1YGL180W 2694 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YKL023WYKL023W 834 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 KTI12YKL110C 942 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 TLG2YOL018C 1194 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 KRS1YDR037W 1776 nt4.77□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 GCR2YNL199C 1605 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 OPI7YDR360W 435 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YJL215CYJL215C 360 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 MID2YLR332W 1131 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YLR463CYLR463C 552 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YIM1YMR152W 1098 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 SCW10YMR305C 1170 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 SCP1YOR367W 603 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 FUI1YBL042C 1920 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 PRP28YDR243C 1767 nt4.76□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 PTR2YKR093W 1806 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 FYV1YDR024W 486 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 NAG1YGR031C-A 492 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 PAN6YIL145C 930 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 PIN2YOR104W 849 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 DCC1YCL016C 1143 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 FRE1YLR214W 2061 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 STR2YJR130C 1920 nt4.75□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 ADD37YMR184W 597 nt4.74□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 GRC3YLL035W 1899 nt4.74□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YJR124CYJR124C 1347 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YGR016WYGR016W 573 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 GPP1YIL053W 753 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 NOB1YOR056C 1380 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 BUD22YMR014W 1560 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 ADE3YGR204W 2841 nt4.73□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 ABF1YKL112W 2196 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 MSE1YOL033W 1611 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YDR154CYDR154C 351 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 MOG1YJR074W 657 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 YGR266WYGR266W 2106 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 ADE4YMR300C 1533 nt4.72□□□□□ -1.65
MSH5Q12175 MCM4YPR019W 2802 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 EUG1YDR518W 1554 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YDL034WYDL034W 345 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 COX26YDR119W-A 201 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 UPS3YDR185C 540 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SCW4YGR279C 1161 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ZPS1YOL154W 750 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 TRS33YOR115C 807 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YPL136WYPL136W 369 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 PZF1YPR186C 1290 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 TRM44YPL030W 1704 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 RIM21YNL294C 1602 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 FDC1YDR539W 1512 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SUM1YDR310C 3189 nt4.71□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SUR2YDR297W 1050 nt4.7□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 DFM1YDR411C 1026 nt4.7□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 IMD3YLR432W 1572 nt4.7□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 STE12YHR084W 2067 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SDA1YGR245C 2304 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YLL059CYLL059C 507 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ARG1YOL058W 1263 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ARR3YPR201W 1215 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 APJ1YNL077W 1587 nt4.69□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 THP1YOL072W 1368 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 OLE1YGL055W 1533 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 GDE1YPL110C 3672 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YCR006CYCR006C 474 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 IWR1YDL115C 1062 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 BNS1YGR230W 414 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 CAB4YGR277C 918 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YNL228WYNL228W 777 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 RPL3YOR063W 1164 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 CAR1YPL111W 1002 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 CBC2YPL178W 627 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ENV7YPL236C 1095 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 DNF2YDR093W 4839 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 FAA4YMR246W 2085 nt4.68□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 PUF3YLL013C 2640 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 YDL144CYDL144C 1071 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 FMP33YJL161W 543 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ECM1YAL059W 639 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SEN34YAR008W 828 nt4.67□□□□□ -1.66
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