Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSC1Q08554 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC1Q08554 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC1Q08554 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms