Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCL1Q07820 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCL1Q07820 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCL1Q07820 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms